При закрытии выходного крана в фильтре растет давление, т.е. на него давит столб воды + помпа пытается "всосать в него воду" увеличивая давление.
При закрытии входного крана в фильтре создается разрежение, т.к. помпа пытается "выплюнуть" из него воду уменьшая давление.
Разрежение считается более опасным для фильтра, поэтому производители в инструкции пишут, что перекрывать поток можно только выходным краном.
При выключении фильтра на него действует только давление столба воды и больше ничего.