По-моему опасения Романа о готовности к черенкованию данного растения оправданы - рано ещё его черенковать, маловато оно. А вот листья, поражённые водорослями удаляйте нещадно. Эта зараза если по всем растениям попрёт, то будет беда. Эта зараза даже на грунте растёт и на декоре. Так что - повнимательнее.
Лобелия часто пускает боковые побеги, вот их и отрезайте поначалу - прекрасные новые растения получатся, а когда растение подрастёт до нормального размера для черенкования, тогда можно и основной побег порезать, чтобы черенок новый посадить и чтобы старый побег дал больше боковых отростков, станет красивее, пышнее.