Рыба производит органику (белок), эта органика может сохраняться в условно первозданном виде (детрит на дне, кисель в воде и т.д.) или под воздействием среды, кислорода и бактерий (при условии их достаточного количества) переходить в различные формы азота (аммиак/аммоний и так далее). Колонии бактерии, которые умеют работать с этими веществами живут в толще воды, на поверхностях, в грунте и больше всего в наполнителях фильтров.
aquahelper
В результате этой жизнедеятельности прямо из рыб появляются аммоний и аммиак или как? Там же есть ещё белок, он же азот?
Да, сначала появляется органика, т.е. белок.
aquahelper
Что именно выделяется из рыб и что из чего преобразовывается в аммиак и аммоний?
Из рыб появляется мочевина, детрит, слизь, т.е. различные варианты органики (белка), которые под воздействием среды преобразовываются в аммиак.