Если исходить из того что слои не перемешаны, то:
Я бы не кормил дней 5 и фильтр пока не мойте.
Нужно будет промыть когда вода в аквариуме станет прозрачной, т.е. взвесь уйдет, но промывать только в воде из аквариума (отливаете в кастрюльку/ведро и в ней губку промываете)
Если же перемешаны, то:
ИМХО перезапуск, т.к. это чревато типичными для открытой подложки последствиями.
ЗЫ. То что в аквариуме нитрат и нитрит - нули не означает, что всё хорошо, а означает, что азотный цикл не встал.
Если померить аммиак, то он будет отличен от нуля.
PilotAlex А ка Вы думаете, рыбсы выживут?
Должны, вода у нас хорошая.