Герметиком мазали прям по мокрому шву, воду не сливали с аквариума, не сушили стыки?
Да из-за крышки тоже такое может быть, когда конденсат там скапливается, например от аэратора.
Можно проверить так:
1. Снять крышку (можно вечером, на ночь, если в ней освещение)
2. Выключить аэратор, либо распылитель сместить ближе к центру аквариума
3. Вытереть всё тщательно
4. По периметру проложить бумажными полотенцами, либо туалетной бумагой
5. Утром посмотреть на результат.
Если всё сухо, то дело было в крышке, если будет влага, то пропускает шов.